SeqBrio：Windows 优先的轻量 FASTA/FASTQ 处理工具包
项目定位
Brio 在意大利语里是”活力”的意思——SeqBrio 的目标就是给 Windows 日常使用提供快速、有活力的序列处理工具，不依赖 Python/Perl/Conda/WSL。
它提供两种形态，共享同一个 Rust 核心库：
- CLI（
seqbrio.exe）：脚本化和批处理场景 - 桌面应用（SeqBrio Desktop）：每个命令一个任务页，图形化操作
四大核心命令
seqbrio stats # 流式统计：记录数、碱基数、GC%、Q20/Q30、N50（可选）
seqbrio cat # 规范化 FASTX（解析后重新输出，FASTA 行宽 0）
seqbrio revcomp # 反向互补（IUPAC 兼容，FASTQ 质量值同步反转）
seqbrio validate # 检测损坏的 gzip、截断的 FASTQ、非法碱基等
定位是一个聚焦的 FASTA/FASTQ 工具包，不是 SeqKit 的重写——不做 BAM/VCF/GFF，不做比对、组装、变异检测。范围之外的想法统一记录在 BACKLOG.md，绝不进入当前里程碑（范围冻结规则）。
路线图（第一阶段：Windows 优先）
| 里程碑 | 状态 | 交付物 |
|---|---|---|
| M0 仓库初始化 | ✅ 当前 | Cargo workspace、三 crate、Windows CI、文档 |
| M1 Windows FASTX I/O | ⏳ 下一步 | 流式 FASTA/FASTQ + gzip 读写 |
M2 stats + validate | 计划 | 统计与校验命令 |
M3 cat + revcomp | 计划 | 规范化与反向互补 → v0.1.0 |
| M4 性能优化 | 计划 | 四大核心命令调优 |
| M5 v0.2 操作集 | 计划 | head / filter / grep / sample / pair |
| M6 桌面端打磨 | 计划 | 任务历史、取消、拖放 |
| M7 v1.0 发布 | 计划 | 便携 ZIP、SHA-256、基准报告 |
第一阶段明确只支持 Windows 10/11 x86-64；Linux/macOS/WSL/Docker/Conda 都是非目标。
工程实践
- Cargo workspace 多 crate 架构（核心库 / CLI / 桌面应用分离）
- Windows CI（GitHub Actions）持续验证
- MIT 许可证
相关链接
- GitHub：Caizhaohui/SeqBrio