SeqFlash：Windows 上流畅浏览 GB 级 FASTA/FASTQ 的桌面工具
为什么需要 SeqFlash
在 Windows 个人电脑上打开一个几 GB 的 FASTQ 文件是什么体验？大多数文本编辑器直接卡死，.seq 工具要么是命令行要么依赖 Python 环境。SeqFlash 就是为这个场景做的：专注一件事——快速打开超大序列文件，流畅浏览、检索、检查、按记录编辑、安全导出，全程低内存占用，面向 Windows 10/11。
技术方案
- 内存映射（mmap）：文件以只读方式映射进内存，按需加载页面，源文件永不被修改
- 虚拟滚动：直接在原始字节上滚动浏览，GB 级文件也无感知延迟
- 增量索引：FASTA/FASTQ 记录边加载边建索引，支持跳转导航
- 覆盖层（overlay）编辑：所有编辑记录在内存覆盖层，中心面板实时预览有效内容，记录列表用
[DEL]/[EDIT]徽章标记
功能一览（当前 M8 里程碑）
| 能力 | 状态 |
|---|---|
| 打开大文件（对话框 / CLI / 拖放） | ✅ |
| 虚拟滚动浏览原始字节 | ✅ |
| FASTA/FASTQ 增量索引与导航 | ✅ |
| 碱基 / GC / 质量值统计（覆盖层感知） | ✅ |
| 增量搜索（字节 / ID / 序列片段） | ✅ |
| 记录复制 + 单记录导出 | ✅ |
| 记录级覆盖编辑（header / 序列 / 质量，删除，前后插入） | ✅ |
| 撤销 / 重做（Ctrl+Z / Ctrl+Y） | ✅ |
| 后台流式保存（带进度与取消，绝不覆盖打开中的源文件） | ✅ |
开发按里程碑推进（M0–M9），目前处于 M8 稳定性与性能阶段，完整的路线图见仓库的 SeqFlash_DEVELOPMENT_PLAN.md，每个里程碑附带验收文档。
工程质量
- Criterion 微基准测试（
scripts/benchmark.ps1） - 属性 / 压力测试（
cargo test --workspace） - 可选的 stdin fuzz harness（
seqflash-fuzz）
技术栈
Rust（stable，x86_64-pc-windows-msvc）+ eframe / egui GUI 框架，Cargo workspace 多 crate 组织（apps/ / crates/ / benches/ / fuzz/）。
相关链接
- GitHub：Caizhaohui/SeqFlash