「生信软件」
PAMlogo：PAM 文库测序分析一站式流水线
面向 Cas9 等基因编辑系统的 PAM 偏好分析命令行工具：从原始 FASTQ 到 WebLogo 图，质控、拆分、PAM 计数、Top-N 筛选、加权出图一条龙。
#Python
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「生信软件」
FretHMM：单分子时间序列 HMM 状态分类工具
介绍开源工具 FretHMM：受 HaMMy 启发、用 Python 重写的单分子轨迹 HMM 分类。覆盖 CLI/GUI、Review Grid、 multi-start + BIC、ON/OFF 与 dwell 动力学，以及 v1.5–v1.6 的批次审查与 Windows 并行更新。
介绍开源工具 microbial-colony-counter：基于 OpenCV 的培养皿菌落自动计数，支持桌面 GUI 与 Web。重点记录 v1.1.1 批次标定与 v1.1.2 多参考盘联合学习，以及从默认参数到少样本校准的开发路径。
给定野生型 DNA 序列，自动生成带重叠区的饱和突变（NNK）寡核苷酸文库——每个位点突变为其余 19 种氨基酸，使用大肠杆菌优化密码子，兼容 Gibson 组装。